都政の事業や予算、仕事の進め方などを調査する都政改革本部。小池知事が本部長を務め、大阪府・市政の改革を支えた上山信一慶応大学教授らで構成する庁内組織として位置付られけている。知事は「都政の主権回復のため、今思い切って改革を進めていかなければならない」と目的を語った。特別顧問からヒアリングを受けた職員からは指示に困惑したり、信頼回復につなげる考えを示す賛否両論の声が上がっている。